《蜂蜜与四叶草第一季》讲述了几名美术大学生的青春故事。竹本与学长真山、曾多次留级的森田住在同一间单身公寓里，日子看似平淡宁静，却总少不了轻松有趣的插曲。一天，他们的老师花本先生向三人介绍了自己的表侄女阿久。外表娇小稚嫩的阿久拥有令人惊叹的艺术天赋，竹本和森田也在与她相遇后不约而同地陷入了爱恋。难以说出口的情愫，与深厚的友情，悄然在三人之间交织蔓延。
与此同时，真山爱上了花本老师的朋友理花小姐，但理花始终沉浸在对亡夫的思念之中，无法走出过去。真山的青梅竹马山田表面上坚强爽朗，内心却因暗恋真山而一次次独自落泪。那个夏天，空气中既有甜蜜，也夹杂着挥之不去的苦涩。四叶草随风摇曳，仿佛在等待那些渴望幸福的孩子伸手采摘。
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