《秘密战队五连者》讲述了一个原本和平的世界突然遭到邪恶军团“黑暗十字军”侵略的故事。面对地球不断加剧的危机，联合国组建了地球保卫联盟，并将军队部署到世界各地，其中一支驻扎在日本。随后，黑暗十字军在日本各地展开破坏行动，分别锁定目标，杀害所有反抗他们的人。浩劫过后，五名幸存者奇迹般地活了下来，并发誓要为死去的人复仇。在指挥官的告知下，他们穿上特殊的电子战衣，运用普通人无法施展的超能力，成为肩负对抗黑暗十字军使命的秘密战士——“秘密战队五连者”。
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