《京来京都了！～两个人的夏天～》讲述了一个发生在夏日京都的故事。空吉（佐佐木藏之介）意外看见本该去东京游玩的女儿美也子（藤野凉子）拖着行李箱，和一名陌生男子一同从京都站走出来。他心中疑惑不已，却还是像往常一样出门进行上门问诊。没想到，在那家提灯铺里，他发现了刚才见过的行李箱，于是自作主张地认定提灯铺的继承人儿子敦彦（结木滉星）正在和美也子交往。
与此同时，美也子在做完豆腐配送的兼职、骑车回家的路上，于鸭川发现了一名独自徘徊的女性。那个人竟是空吉昔日的恋人佐知子（松本若菜）。空吉曾听说佐知子再婚后搬去了很远的地方，可她为何会再次出现在京都？当美也子询问后才得知，原来佐知子的再婚根本是一场谎言……
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