《反贪风暴2》讲述了廉政公署调查马会球赛博彩操盘手（尹子维 饰）涉嫌违法一事时，意外发现对方遭杀手（周渝民 饰）杀害。廉署首席调查主任陆志廉（古天乐 饰）成为案件目击证人，并接受重案组督察刘保强（张智霖 饰）的调查。随后，廉政公署与警方联手追查真相，但双方始终相互戒备，关系十分微妙。根据刘保强线人提供的线索，博彩集团背后的真正操盘者，是一个被称为“华老师”的神秘人物。陆志廉顺着线索逐步逼近目标，却因对方异常狡猾，屡次让其逃脱。与此同时，马会内部又有一名前廉署人员遇害。金钱利益的诱惑之下，人性一步步走向失控。
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