宿命般的相逢过后，佐佐木小次郎（鶴田浩二 饰）闭门苦练，立志击败宫本武藏（三船敏郎 饰）。随后，他前往江户谋求官职，并在那里再次遇见武藏。两人相约于东门决斗，然而就在决斗前夜，武藏突然写信，请求将比试推迟一年。
第二天，武藏带着城太郎（樱井将纪 饰）和熊五郎（田中春男 饰）来到乡间。师徒三人一边耕种土地，一边传授农民武艺，帮助他们抵御土匪。其间，阿通（八千草薰 饰）与朱实（冈田茉莉子 饰）先后来到此地寻找武藏，朱实却不幸死于匪乱之中。
一年之后，小次郎成为细川家的家臣，而岩流岛也即将成为他与武藏改变命运的决战之地……
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