问心2讲述了两年后，周筱风结束援黔工作归来，与林逸、方筱然重新会合，三人再度组成并肩作战的“小分队”，共同迎接接踵而来的全新挑战。始终执着进取、恪守医疗原则的周筱风，在机缘之下被破格提拔为东立医院历史上最年轻的心内科执行主任。职位的变化为他打开了更多可能，也带来了更大的考验，同时打破了他与林逸、方筱然之间原有的相处关系，甚至影响到医院内外原本的生态平衡。
与此同时，医生们还要直面始终如影随形的对手——病魔。一个个患者带着家人的期盼来到他们面前，等待医护人员携手争取生的希望。理想与现实不断碰撞，无奈与温暖彼此交织，周筱风、林逸和方筱然也将在一次次坚守与奋斗中继续成长，努力做到问心无愧。
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