机动部队—同袍讲述森（任达华饰）与May（邵美琪饰）分别带领两支机动小组执行任务的故事。两队成员一直暗中较劲，May的小组因得到何长官赏识而变得娇纵傲慢，让森的队员心有不甘却又无可奈何。机动小组即将解散之际，执勤最后一天却发生了一宗抢劫案，劫匪逃进荒山。两支小组被迫合并，上山展开地毯式搜查。搜捕过程中，离奇状况接连发生，队员之间积累的矛盾也不断激化，最终森与May分头行动，并各自遭遇重重险阻。另一边，负责为队员送饭的肥棠（林雪饰）因汽车抛锚而意外碰上劫匪。山林之中，警察与强盗展开了一场怪异而惊险的捉迷藏，而PTU同事之间的友情也面临严峻考验。
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