影片将故事置于11世纪的波斯。为了学习医术，一名英国人隐藏自己的天主教徒身份，进入伊斯巴罕一所只招收犹太人的医学院。在那里，他师从阿维森纳——历史上著名的犹太科学家、思想家和医生。阿维森纳一生著述超过200部，其中《哲学、科学大全》是当时具有较高水准的百科全书；另一部巨著《医典》直到17世纪仍被西方国家奉为医学经典，至今依然具有参考价值。《神医》将史诗般的叙事与虚构元素相结合，展现了在愚昧与迷信笼罩的年代里，一群人不畏艰险、勇于探索真知的精神。
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