感染2004讲述了一家破旧医院的惊悚故事。医院正在进行改造，却因经费紧张濒临倒闭，院长也在此后神秘失踪。恶劣的医疗条件让医院不堪重负，为了节省开支，甚至不得不重复使用已经用过的针头。病患得不到妥善照料，医护人员与病人都陷入焦躁和不安之中，混乱之下，医疗事故终于发生。
一次抢救过程中，小护士安积圆（星野真里 饰）一时慌乱，将氯化钾误当成氯化钙注入病人体内，导致病人死亡。经过激烈争论，参与抢救的鱼住大夫（高嶋政伸 饰）、秋叶大夫（佐藤浩市 饰）以及其他护士达成共识，决定隐瞒这起事故。表面上，一切仿佛从未发生，也没有人察觉真相。然而，这场掩盖并未让事情结束，反而成为一连串恐怖事件的开端。不久之后，一种神秘而致命的病毒开始在这家濒临崩溃的医院内蔓延……
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