《法证先锋3国语》的故事延续法证先锋系列，主角是法证部高级化验师布国栋（黎耀祥 饰）。被称为“人肉百科全书”的国栋知识渊博，始终保持学习的习惯。他与法医科高级医生钟学心（张可颐 饰）既是工作上的伙伴，也是生活中的好友，两人经常共同破解办案难题，并彼此倾诉生活中的烦恼。
钟学心的好友凌倩儿（徐子珊 饰）任职于西九龙重案组，是一名身手不凡的高级督察，与警长李展风（吴卓羲 饰）组成默契十足的搭档。法医部和警方因各种案件频繁合作，在众人的共同努力下，一宗宗棘手案件最终得以侦破。
另一方面，布国栋与妻子周奕霏（胡定欣 饰）因观念不合，最终以离婚收场。而他与钟学心之间的感情也逐渐升温，随着学心童年那段悲惨经历被揭开，两人的目光再次投向新的案件。
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