梯族人为争夺资源，迅速向蛙人国发动进攻。蛙族接连失去多个移民星球，只得仓促展开防御。钢兽、康、贝克、大炮等人为了抵抗梯族侵略进入军校，并在机甲陆军学院相识，随后成为并肩作战的好友。
几人先后结识了世袭，之后又参与峰盐与明队长共同执行的补给任务，见到了备受众人敬重的明队长以及其他前线战士。原本被认为十分安全的补给行动，却遭到梯族名将巫帝、利普顿等人的突袭。为了保护学员兵，峰盐奋力迎战，最终第二舰队几乎全军覆没。
蛙族高层对这场失利十分不满，明队长主动承担全部责任，并因峰盐的牺牲数度落泪。就在高层准备重新组建第二舰队之际，以钢兽等人为首的学员兵接受授衔，正式加入AIU突击队，成为明队长麾下的战将，实现了他们一直以来的愿望。
与此同时，遭到侵略者追杀的上官狼和上官鹰兄弟进入军校后进步神速，并意外见到了蛙族顶尖舰船技术的结晶——鱼骨刺突击舰。蛙族人也正在酝酿一场重大的自卫反击战。
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