《她从深渊来》中，曾经的妇产科医生林雅芝（穆乐恩饰）在五年前生下孩子后，便长期受到抑郁症的困扰。尽管一直接受抗抑郁治疗，她的病情始终没有明显好转。这个曾经的天之骄女，在精神疾病的反复折磨下逐渐失去自信。
林雅芝的丈夫陈墨（冯铭潮饰）是心理学催眠专家，同时也是医院院长。由于坚持不为亲近的人提供治疗，他没有成为妻子的主治医生，却在管理医院的同时，替林家处理了许多生意上的琐事。林雅芝觉得，陈墨虽然表面上依旧对自己关怀体贴，内心深处却早已厌恶那个病恹恹的自己。
为了帮助女儿恢复，林雅芝的父亲找来了自己的得意门生左梦洁。两人从小就是朋友，也是彼此的竞争对手。起初，林雅芝对左梦洁的治疗心存疑虑，但左梦洁通过几次催眠，逐渐打消了她的戒备。为了不让自己的病情继续影响家庭生活，林雅芝雇用了保姆孟小婷（祝昕愿饰），却也因此一步步揭开了尘封的往事，以及陈墨隐藏的秘密。
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