A-1头条讲述了记者玲（李心洁饰）追查男友离奇死亡真相的故事。玲的男友Peter得到一宗刑事案件的线报，赶往现场取证时却突然遭遇交通事故身亡。玲不相信这只是意外，深入调查后，发现事件牵涉一宗模特命案：女模特Helen被发现裸死在家中的浴缸里，而富豪之子张承志虽然没有不在场证明，案件却被警方低调处理，连与他有关的证据也遭到清除。
为了不让男友枉死，玲决心查明真相。然而，报社总编辑曾达时（梁家辉饰）不愿出手相助，她只好向经常被追债的飞（黄秋生饰）及其马仔（葛民辉饰）求助。飞原是警察，在调查过程中逐渐发现Peter的死因确实另有隐情。随着真相一步步浮现，幕后黑手不断设法置玲于死地。一场关于真相与言论自由的追逐，就此在香港午夜展开，而这宗案件最终能否登上报纸的A1头条，也成为所有人关注的焦点。
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