精灵宝可梦：幻影的霸者索罗亚克讲述了发生在风景优美、气候宜人的王冠市的故事。神奇宝贝足篮世界杯即将在这里举行，届时各地观众和训练师将齐聚一堂，让整座城市沉浸在热闹欢乐的氛围中。小智（松本梨香配音）一行人在前往王冠市的途中，遇到了一只神秘的神奇宝贝索罗亚。索罗亚不仅能够幻化成人类的模样，还可以通过心电感应与人类交流。小智与索罗亚结伴同行，却没想到王冠市突然爆发神奇宝贝暴动。原本负责守护城市的雷公、炎帝和水君不知为何向市民发动攻击，整座城市陷入混乱。而这一连串事件的幕后主使，正是企业家克林克斯（阵内孝则配音），同时也是索罗亚一直想要寻找的同伴。
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