《巴啦啦小魔仙之魔法的考验》讲述了美琪（赵金麦 饰）和美雪（刘黛希 饰）参加第五级魔仙考试，却因成绩不及格而陷入困境。姐妹俩用真诚打动了魔仙女王（王慧 饰），终于获得重考机会，但她们仍需接受惩罚，被安排到魔仙藏书室打扫。
与此同时，魔力强大的黑精灵费多巴（崔倓 饰）策划潜入人类世界四处破坏，并控制少女妙妙（杨心仪 饰），企图以此要挟美琪、美雪等人放弃魔法。面对强敌，三人法力不敌费多巴，幸好游乐王子（徐可 饰）及时赶到，帮助她们化解危机。虽然三人安然无恙，费多巴却趁机逃脱。
魔仙女王随即命令游乐王子参与寻找费多巴，并提醒小蓝（陈雨薇 饰）、美琪和美雪，费多巴一定不会就此罢休。危急关头，小蓝与美琪、美雪并肩作战，最终战胜了邪恶的费多巴。由于小魔仙们成功将功补过，魔仙女王破例允许美琪和美雪继续担任见习小魔仙。与此同时，妙妙与萱萱等人化解了矛盾，成为好友，妙妙还接受萱萱的邀请加入舞蹈剧团，和大家一起参与演出，用爱与友情为观众献上精彩而感人的歌舞。
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