《新干线变形机器人剧场版来自未来的神速ALFA-X》改编自电视动画《新干线变形机器人新干线战士》，讲述驾驶由现实中新干线“E5系隼号”“N700A希望号”等列车变形而成的机器人“新干线战士”的孩子们，与大人们并肩作战、对抗敌人的故事。
本作中，为研发下一代新干线而制造的试验车辆“ALFA-X”化身为新干线战士登场，并与一位全新的驾驶员携手投入战斗。面对企图进攻地球的新敌人纳哈涅，隼斗等“新干线战士小队”再次踏上战场。然而，在纳哈涅的袭击下，隼斗的父亲北斗突然下落不明。正当隼斗难掩不安之时，9岁的北斗竟跨越时空出现在他面前。为了守护地球，并回到自己原本所属的时代，穿越而来的少年北斗决定成为由最新技术集结完成的“新干线战士ALFA-X”驾驶员。少年北斗由声优钉宫理惠配音。
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