《对与决》以1927年的中国为背景，白色恐怖笼罩大地。中共地下党员夏风与朱雷在咖啡厅秘密接头时，遭到国民党特工高扬伏击。朱雷年仅十二岁的女儿朱美云亲眼目睹父亲遇害，夏风也身负重伤被捕。夏风的未婚妻、进步学生陆玫强忍悲痛，带着朱美云匆忙逃离。
十年后，上海沦为孤岛。已经成为中共炸弹专家的陆玫与组织失去联系，辗转流落上海；而成长为狙击手的朱美云，也为了替父亲报仇回到这里。两人意外与仇人高扬重逢，在民族大义面前选择暂时放下个人恩怨。爱国护士孟香兰、青帮阔少赵非及其保镖叶三、女游击队员铁妞等人陆续加入，一支特殊的敌后抗日小队由此组建。
梅机关副机关长渡边暗中策划南北汉奸合流，军统与七十六号之间也展开了残酷较量，同学与朋友被迫成为彼此厮杀的对手。秉持共同抗日的信念，陆玫带领小队协助高扬，惩治了一批罪大恶极的汉奸，却也因此付出惨痛代价。军统上海站被端，中共联络员老马壮烈牺牲。最后，陆玫用计，……
