《凤穿牡丹》将故事置于20世纪20年代的中国。那是一个军阀割据、外敌入侵的动荡年代，满目疮痍的九州正陷入深重苦难。原本已遁入佛门的无瑕，为寻找身在苏州的家人踏上逃亡之路。
无瑕出生于以刺绣闻名的苏州郁家，命运却让她早早尝尽人生的凄苦。家人终于接纳她后，父亲又因被指认为保皇党而含冤离世。临别之前，父亲将家传刺绣绝技凤穿牡丹传给无瑕。然而，这门技艺没有为她带来荣耀，反而像一道无法摆脱的魔咒，牵动着她与整个家族的命运。
面对与霍冬青的爱恋、同妹妹芷岚之间复杂的爱恨纠葛，以及国家生死存亡的大时代洪流，无瑕柔弱的双肩承受了远超常人的重担。她守护的既是郁家的传世绝学，也承载着更深层的意义。
