《极度危机2004》讲述了一个发生在风雨之夜的惊险案件。两名衣不蔽体的中国籍女模特仓皇逃向中国驻曼谷大使馆，途中遭到数辆轿车追击并引发枪战，其中一人当场遇害，另一人虽被救出，却因毒品过量而生命垂危。
中国公安部获悉情况后，立即派滨海市刑警队长李国豪与警员魏芳前往曼谷调查。根据幸存者提供的线索，警方发现这起事件与一个庞大的黑帮组织有关。该组织控制着许多来自不同国家的女模特，目的并非单纯卖淫，而是将她们用于贿赂亚洲各大城市的政府官员和警方高层。这个总部设在香港、名为沙氏集团的犯罪集团，势力早已渗透多个地区。
李国豪与曼谷警方展开营救行动，黑帮成员刚被捕便遭到灭口，负责行凶的枪手落网后又被曼谷警长杀死。接连发生的异常事件令李国豪震惊不已，也让他确认曼谷警方内部已经被黑势力渗透。公安部随即命令他返回香港，联合香港警方彻查此案。
调查显示，沙氏集团的首脑沙爷曾是黑道上声名显赫的人物。几年前他退隐后，集团由其子沙麦克接掌。沙麦克手段狠毒、心机深沉，早在父亲退隐前便安排大量骨干成员潜伏警方内部。凭借这些内应，他不断扩张地盘、跨国犯罪，势力迅速壮大，并企图控制整个亚洲的毒品市场。
警方展开调查之际，沙麦克也启动了一个惊天阴谋。为了确保数吨新型冰毒顺利入境，他重新整顿组织、清洗内部成员，同时派人制造绑架和刺杀案件，以扰乱警方视线。随着多名卧底接连被杀，警方的调查线索彻底中断，而巨量毒品也已经安全进入境内。案情陷入极度危机之中。为维护国家利益、保障民众生命安全，公安部下令联合国际刑警组织与香港警方，代号为雷霆行动的跨国缉毒行动正式展开。
