《神医大道公》讲述了保生大帝与同门师兄弟瘟君历经千年的较量。眼看斗法落于下风，瘟君便煽动众神向玉帝告状，罗列保生大帝的种种“罪状”。玉帝震怒之下，将保生大帝贬入凡间，并命他完成一项看似不可能的任务：把一个品行顽劣的医官培养成名医，否则永远不得重返天庭。就这样，保生大帝化身民间郎中吴本，开始了在人间的历练。凭借高超医术与过人智慧，吴本逐渐赢得渔家女三红的倾心；同样因瘟君陷害而被贬下凡的黑龙和白虎，也成为他的伙伴，始终陪伴左右。与此同时，惯于以害人为乐的瘟君在与吴本的较量中屡屡败北，最终被玉帝贬为凡人。然而，他并未因此放弃继续作恶。
