《大漠高墙》以20世纪初新疆监狱的改革与发展为背景，围绕监狱高墙内外发生的平凡故事，展现改革进程中的观念碰撞与人性抉择。年轻机关民警萧凡自愿前往地处大漠的库亚西监狱，担任监区长。他坚持文明执法、寓情于教，先后推行亲情帮教、视频网络等举措，组建女警中心，推动监区面貌逐步发生改变。
剧情以改造、教育、回归和心理等内容为脉络，呈现改革与保守、创新与传统之间的激烈交锋，讲述监狱调整过程中跌宕起伏的故事，塑造了一批鲜活的监狱民警形象。影片从监狱民警在生活与工作、亲情与原则之间的两难选择出发，表现他们肩负历史使命，勇于探索创新、坚持严格文明执法的责任担当，以及对党的监狱事业始终不渝的忠诚与奉献。
在重铸罪犯心灵的同时，监狱民警也致力于改造自然、改善环境，使大漠戈壁发生巨大变化，监管手段日趋完善，现代化文明监狱的创建步伐不断加快。
