《萌族酷狗侦探第三季》讲述了发生在都市公寓“萌居”里的欢乐故事。天才发明家兼IT专家大侠，与爱做白日梦的同窗好友、三流网络作家奇龙合租于此。两人制造出许多智能AI机器人，和他们共同生活的还有把狗当孩子疼爱的少女萌萌、落魄佳人美君、风流成性的画家达志，以及经营坑爹网店、同时担任散打王陪练的熊熊。
一次突发奇想，大侠和奇龙把萌萌的爱犬小八带去进行智力提升实验，没想到实验成功，小八不仅拥有了超高智商，还学会了人类语言。为了不让萌萌发现这个秘密，两人只好不断讨好、贿赂小八。与此同时，大侠和奇龙所在的机器人中心遭到神秘入侵，他们便带着小八展开调查，试图揭开一连串案件背后的关联。
随着调查深入，小八结识了风烛残年的昔日英雄老狗、沉迷纸醉金迷生活的网红狗狗美女、温婉可亲的狗族邻家妹妹，以及令人头疼的同胞兄弟小九。在伙伴们的陪伴下，小八经历着充满欢笑与波折的爱恨情仇，也逐渐踏上成长之路。AI时代，各式各样货真价实的智能机器人轮番登场，时而呆萌犯傻，时而机智勇敢，与人类共同演绎热闹不断的同居生活。然而，神秘黑客和仿生机器人的相继出现，也让原本就复杂的案件变得更加扑朔迷离。
