1945年，游学归来的刑侦专家程慈航在码头遭遇险情，几方势力为了争夺一只铁箱展开血腥厮杀。箱中藏有日军细菌武器的绝密档案，警察厅厅长莫采石将其转移至档案馆密室，没想到档案却在当夜被人盗走，案件也由此陷入重重迷雾。
得知失窃档案牵涉日军细菌武器后，程慈航向叔叔莫采石主动请缨。总署刑侦警察局局长霍然随即特聘他担任布衣侦探。上任后，程慈航凭借敏锐的推理能力迅速发现线索，并顺藤摸瓜接连取得重大突破。然而，每当真相即将浮出水面，相关人员便会被幕后之人抢先灭口，调查也因此屡屡受阻。幕后黑手究竟是谁？丢失的档案又藏在何处？程慈航能否破解这场危机四伏的谜局？答案尽在《昙花梦》。
