激情年代1996的故事发生在1692年的马萨诸塞州，一个偏远小镇里住着一群虔诚却愚昧的居民。牧师的侄女阿比盖尔（薇诺娜·瑞德 Winona Ryder 饰）因身份特殊，在镇上备受尊敬。人们相信她所说的一切，也认可她的所作所为。仗着这份信任，阿比盖尔以女巫之名指控了数十名她看不顺眼的女子，使她们被送上绞刑架，其中包括约翰（丹尼尔·戴-刘易斯 Daniel Day Lewis 饰）的妻子伊莉莎贝斯（琼·艾伦 Joan Allen 饰）。
约翰早已看穿阿比盖尔的野心，只因两人曾有过情人关系，他始终选择沉默。直到伊莉莎贝斯也成为阿比盖尔陷害的目标，约翰才意识到事态已无法继续放任。于是，他向法官揭露阿比盖尔的罪行，却没有人愿意相信他的指控，反而将其视为无稽之谈。
