《胡越的故事》以1975年越战结束后的香港为背景。当时香港一度成为接收越南难民和船民的第一收容港，抵达者会被港府统一安置在羁留营，而混入其中的越共一旦被特工发现，往往会遭到秘密杀害。
越南华裔胡越（周润发）在战乱中死里逃生，随后与伙伴一同逃难来到香港，并终于见到多年通信、却从未谋面的笔友李立君（缪骞人）。身为社会工作者的李立君同情胡越的遭遇。胡越反杀了将他当作越共的特工后，李立君决定帮助他办理前往美国的假护照。办理过程中，胡越结识了同样命运坎坷的沈青（钟楚红），两人约定抵达美国后一起生活。
然而，胡越、沈青等人在菲律宾转机时，沈青和几名女孩被替他们办理护照的人暗中带走。为了寻找沈青，胡越放弃了前往美国的机会，胁迫对方来到菲律宾唐人街的一家酒吧，才发现沈青被骗到这里，被迫以酒吧女郎的身份工作，实际上沦为妓女。为了兑现照顾沈青的承诺，胡越答应替酒吧老板钟仁（金彪）充当杀手，并与另一名杀手阿三（罗烈）结为兄弟。然而，胡越、沈青和阿三最终都只是钟仁掌控下的棋子。
