《龙卷风（下）》讲述了爱普尔（米密·罗杰斯 Mimi Rogers 饰）与西恩（安德鲁·爱尔莱 Andrew Airlie 饰）的故事。两人是一对感情深厚的兄妹，原本生活在平静幸福的家庭中，却在一场突如其来的龙卷风袭击城市时，亲眼目睹双亲被风暴吞噬。
18年后，爱普尔和西恩都已长大成人，但他们选择了截然不同的人生道路。爱普尔投身于龙卷风研究，希望更深入地了解这种可怕的自然灾害；西恩则搬到西雅图生活，因为那里遭遇龙卷风的概率极低。一次偶然的发现，让爱普尔察觉到当地天气异常，一场可怕的风暴灾难正逐渐逼近西雅图。
