《毛骨悚然撞鬼经2013夏季特别篇》由五个诡异故事组成。《恐怖的二楼》中，少年畑野龙（铃木福 饰）似乎天生拥有灵视能力。他随外婆和妈妈（YOU 饰）搬进新家后，逐渐发现这栋房子里居住的并不只有他们一家。小龙看到了女鬼，但妈妈始终不肯相信他的说法。
《X医院》中，实习医生佐佐木直树（藤谷太辅 饰）因遭遇挫折而承受着巨大压力。就在这段时期，各种难以解释的怪事接连发生在他身边，让他疲于应付。
《影子的暗示》里，厌倦单调工作的远山美和（深田恭子 饰）打算转行到旅游公司。可在准备转职的过程中，她总会看见神秘的黑影，而每当黑影出现，灾难也随之降临。
《女子高中大危机》讲述了在女子高中任教的泽木洋介（坂口宪二 饰）。他发现班上的女孩亚里沙似乎建立了一个地下网站，却没有意识到，一场可怕的危机正逐步逼近这所高中。
《蠕动的人偶》中，园田里菜（指原莉乃 饰）在街头看中了一尊士兵人偶，随即将它买回家。然而，这个仿佛拥有生命的玩偶，开始一点点影响她的日常生活。
