三体·周年纪念版讲述了2007年地球基础科学陷入异常扰动后的故事。接连发生的科学家离奇自杀、仿佛神迹般出现的倒计时，以及行踪隐秘的“科学边界”组织，让整个科学界陷入不安。纳米科学家汪淼在警官史强的带领下前往联合作战中心，并以协助调查为名潜入“科学边界”。随着调查深入，两人逐渐接触到名为ETO的神秘组织，也揭开了《三体》游戏背后的秘密：这场看似虚拟的游戏，实则牵连着两个文明为争夺生存空间而展开的生死较量。在众人的共同努力下，汪淼、史强等人坚定信念、重新燃起希望，并带领大家共同迎接即将到来的人类危机。
